23 мая 1899 г. в Уфе произошла закладка каменной Никольской церкви (вокзальной). Вокзальная Никольская церковь при железнодорожном вокзале «Уфа», находилась до середины 1920-х гг. на углу ул. Вокзальной и К. Маркса. Она была построена для того, чтобы пассажиры железной дороги смогли ее посетить во время стоянки поезда. Сначала в 1897 г. была освящена деревянная церковь во имя святителя и чудотворца Николая при железнодорожном вокзале, затем на ее месте в 1899 г. была заложена большая каменная пятиглавая церковь с колокольней. Говоря о церкви, уфимцы всегда подчеркивали, что она «вокзальная», так как в Уфе к ее открытию уже стояла Никольская церковь на Пушкинской улице. Вокзальную Никольскую церковь закрыли в 1924 г., самой первой из церквей города. В ней разместили сначала клуб железнодорожников, затем Уфимский филиал Самарского железнодорожного института, Уфимский железнодорожный техникум-колледж. С 2004 по 2020 годы вокзал реконструировался. В здании железнодорожного вокзала появились современные залы, удобные кресла, удобная система ожидания. Разделены потоки пассажиров, исчезли очереди. Организована схема движения общественного транспорта, решается проблема с парковками.